En Santa Fe y en buena parte de Argentina, estar en bolas es estar desnudo, en pelotas, sin ropa ni dignidad. También se usa en sentido figurado para decir que estás perdido o no entendés nada, como cuando te tiran un tema complicado y te quedás mirando al vacío. Es bien de charla cotidiana y suena fuertecito, pero común.
En Uruguay se usa para dos cosas según el contexto. Una es estar totalmente desnudo, sin una sola prenda encima. La otra es estar re perdido, no entender nada de lo que pasa, como si te hablaran en chino antiguo. Es bastante coloquial y un poco guaranga, pero hay que admitir que tiene su encanto.
En Argentina se usa para decir que estás desnudo, en pelotas, sin ropa ni excusas. También vale en sentido figurado: estar perdido, no entender nada o no tener idea de qué está pasando. Es bastante común y medio bruto, pero justo por eso suena tan directo y gracioso.